ASP.NET应用程序主要有以下特点：

　　可以将ASP.NET应用程序拆分成多个项目以方便开发，管理和维护。

　　可以从项目中和源代码管理中排除一个文件或项目。

　　支持VSTS的team build 方便每日构建。

　　可以对编译前后的名称，程序集等进行自定义。

　　对App_GlobalResources的 Resource强类支持。

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ASP.NET 网站编程模型具有以下特点：

　　动态编译该页面，而不用编译整个站点。

　　当一部分页面出现错误不会影响到其他页面或功能。

　　不需要项目文件，可以把一个目录当做一个web应用处理。

基本上，ASP.NET网站适用于较小的网站开发，因为其动态编译的特点，无需整站编译。而ASP.NET应用程序适应大型的网站开发，维护等。